课程介绍:
本课程主要是针对转录组结果数据进行挖掘分析,将从常用的转录组生信分析基础入手,带领大家学习转录组分析中常用的分析方案、个性化分析软件及其实现方法,其中包含热点的WGCNA分析,热图绘制,差异基因分类分析等绘图分析。满足转录组文章常见分析展示需求。
课程内容:
二代RNA建库原理基础培训
二代测序原理基础培训
实操----植物组织样取样、送样及包装指导
转录组在不同领域的方案设计、研究思路和经典案列
基于动植物及多组学转录组文章数据挖掘思路分享
转录组文章内容复现及实操演示
转录组分析基础讲解
基因功能注释
差异基因分类
基因共表达分析
Heatmap分析(R代码、可视化版)
箱线图、PCA图、小提琴图(R代码、可视化版)介绍与实操
GSEA功能富集分析 原理+实操+结果讲解
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课程介绍:
本课程的主要目的在于帮助大家掌握linux系统下基于qiime2软件对微生物多样性数据进行处理和分析的方法,主要内容包含linux的基本操作、原始测序数据的过滤及拼接、OTU聚类及物种注释、多样性分析、差异分析和功能预测等内容。同时,分析中的每一个步骤以及每一步骤所涉及的参数都很明确的列了出来,详细为大家进行讲解及实操演示,帮助大家更好的了解学习微生物多样性分析的整个过程。
课程内容:
微生物多样性整体介绍
标准分析
Linux基础
数据质控
OTU分析
物种分类分析
alpha多样性分析
Beta多样性分析
组间差异分析
功能预测分析
样品机器学习与预测
原始数据上传NCBI