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基因组重测序(Re-Sequencing)是对已知基因组序列信息的个体进行测序,可在此基础上对个体或群体进行基因型差异性分析。基因组重测序主要用于辅助研究者发现大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、插入缺失(InDel,Insertion/Deletion)等变异位点,以高效准确获得生物群体的遗传特征,并方便进行全基因组关联性分析(GWAS),在人类疾病和动植物育种研究等方面意义重大。Types of genome alterations that can be detected by next-generation sequencingMeyerson et al., Nature Reviews Genet
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Small RNA主要包括miRNA、piRNA、tsRNA(tRFtiRNA)、snRNA和snoRNA等,是一类不具有蛋白编码能力的RNA分子,能调控基因表达,在细胞生长、发育和代谢等基础生物学过程中都扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中也起着关键的作用。高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性生成上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异,并可以联合转录组测序表达谱数据进行关联分析。A workflow for Small RNA Sequenci
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全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA,miRNA,并且通过两两关联分析、三元关联分析、多元关联分析,使研究内容更加系统化,致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。ceRNA(竞争性内源RNA)机制示意图Wang Y et al., Trends Genet, 2016我们的优势1. 双文库构建:small RNA文库和去核糖体的链特异性文库,8年建
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外显子仅占人类基因组的2.5%,但包含了基因表达相关的绝大部分信息。该区域的变异与癌症、单基因遗传病、部分复杂疾病等密切相关。外显子捕获测序仅对外显子区域的序列进行测序,相对于基因组重测序成本较低,可以用很小的数据量获得大量有用信息,对研究基因的SNP、InDel等具有很大的优势。Aglient SureSelect外显子捕获系统 (www.Agilent.com)我们的优势1. 整合已有数据库的同时,可以发现全新的突变位点;2. 采用生物信息学领域权威的外显子数据分析流程,并有高分文献支持;3. 整合最新的注释数据库,确保结果的准确性和高验证率;4.
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基因组重测序(Re-Sequencing)是对已知基因组序列信息的个体进行测序,可在此基础上对个体或群体进行基因型差异性分析。基因组重测序主要用于辅助研究者发现大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、插入缺失(InDel,Insertion/Deletion)等变异位点,以高效准确获得生物群体的遗传特征,并方便进行全基因组关联性分析(GWAS),在人类疾病和动植物育种研究等方面意义重大。Types of genome alterations that can be detected by next-generation sequencingMeyerson et al., Nature Reviews Genet
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16S rDNA测序是原核生物中编码核糖体小亚基rRNA的DNA序列,承担着许多重要的生物学功能。其具有9个高变区域(V1-V9)和10个保守区域,保守区反映细菌种属间亲缘关系,而高变区则反映了物种间的特异性。因此通过分析16S rDNA 可变区的序列即可得到各细菌的分类学特征,结合高通量测序可研究环境或者临床样本中的微生物组成及群落功能。Bacterial 16S rDNA sequencing workflowKong HH., Trends in Molecular Medicine. 2011我们的优势1.更多的Reads数:所测Reads数达100000条,同成本下相较于Miseq,能检测更多的测序序列和稀有微生物;2.
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是将染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)与二代测序相结合的表观遗传研究技术,能够高效地在全基因组范围内对DNA和蛋白的相互作用进行检测,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。ChIP-seq Assay Kit for Histone Methylation(Laboratorytalk,2016)我们的优势1.定制化分析策略:根据不同测序方案和测序目标,定制化选择比对算法、Peak Calling算法以及注释用数据库区域信息;2.强大的自研能力:拥有已发表的自主开发Peak Calling算法(Wang et al., BMC Bioinformatics, 2010)和定位注释系统以
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单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。2013年,单细胞测序技术被《Science》将其列为年度最值得关注的六大领域榜首;2015年再次登上Science转化医学封面。目前,单细胞测序技术在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学、以及植物学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点,具有广阔的应用前景。单细胞转录组测序流程--点我了解更多我们的优势1.
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DNA甲基化(DNA methylation)是基因调控的手段之一,在维持细胞正常功能、传递基因组印记、胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用,更是表观遗传学研究的热点。全基因组甲基化测序(Whole GenomeBisulfiteSequencing,WGBS)作为甲基化测序的“金标准”,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行全面、高效、高准确度的甲基化研究,从而构建单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化水平图谱。哺乳动物DNA甲基化主要为CG型,而富含CpG二核苷酸的CpG岛常位于转录调控区附近,与56%的人类基因组编码基因相关。Agilent公司推出的CpG岛精准甲基化
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转录组测序(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。A workflow for RNA-seqRuairi J, Genomics Research, 2018我们的优势1.八年转录组测序分析经验,自主研发了多个生物学领域内认可的软件,如差异可变剪接算法ASD、CASH等,检出率和准确度超过同类软件;2. 不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,
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